Certificado de nacimiento que puede causar problema en un futuro

Mi hijo al nacer le puse en el certificado de nacimiento el apellido del papá y mamá separados por un Girón. Me han dicho algunas personas que eso puede causar problema pero otras personas dicen que no porque está separado por el gion. El pasaporte de el solo tiene el apellido del papá.

Mi pregunta es mi niño va a sacar permiso para poder manejar el permiso de la licencia saldría con los dos apellidos o sólo con un apellido como en el pasaporte. Aunque en el certificado y en el seguro social salgan los dos apellido.

También me gustaría saber si puedo eliminar el apellido materno del certificado de nacimiento y cual serían los pasos a seguir para el trámite. Me gustaría sabar si tendría problema o no en el futuro en caso de no poder eliminar el apellido de la madre.

Argelys Reyna